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ニュートリノは電子型、ミュー型、タウ型の３種類。研究チームは、宇宙線が地球の大気とぶつかって生じるミュー型と電子型を観測した。だが、理論上はミュー型の数が電子型の２倍あるはずなのに、実際に観測できたのはほぼ同数だった。
ミュー型が理論値の半分しかない理由としてチームは、ミュー型が長距離を移動する過程で、スーパーカミオカンデでは観測できないタウ型に変わったためと推定した。
ニュートリノが別の種類に変身する現象は「ニュートリノ振動」と呼ばれる。この現象は、ニュートリノに質量がなければ起きないことから、「ニュートリノに質量がある確証が得られた」と結論付けた。
ニュートリノ振動が確認されたのは世界で初めてだったため、９８年６月の国際会議で成果を発表すると、日本だけでなく米ニューヨーク・タイムズ、ワシントン・ポストなど有力紙が１面で報道、クリントン米大統領（当時）が祝福コメントを出すなど世界的に大きな反響を呼んだ。