こっちに詳しく書いてあった
http://www.tokyo-np.co.jp/article/national/list/201612/CK2016122702000121.html
三浦九段には、複数の棋士から「特定のソフトが示す手と指し手の一致率が高い」と、不正を指摘する声が出ていた。しかし、調査委が調べたところ、一致率は計測のたびにばらつきがあり、他の棋士にも同程度の一致率の対局が数多くあったことなどから、「不正認定の根拠に用いることはできない」と判断された。
さらに三浦九段から提出を受けた、本人と家族のスマートフォンやパソコンを解析した結果、不正の痕跡は確認されなかった。トップ棋士への聞き取り調査の結果も、三浦九段の指し手は「自力で指した手として不自然ではない」との意見が多数を占めたという。
人間だろうがコンピューターだろうがそのときの最善の手を探したら多少一致するのは仕方がないんだろ