manifest.jsonのcontent scriptsの記述によるcssの挿入ではなく、
jsでの挿入で行けた。
$(head).append($('<link rel="stylesheet" href="'+chrome.extension.getURL("/Css/mokoMain.css")+'" type="text/css">');
まだ、動作不安定なのかな・・・それともrun_atの設定でクリアできるのかな。
最新のmokoで置き換えしようと思ったが、90の状況だから、それは危険だなー