南スーダンの国連平和維持活動（ＰＫＯ）に派遣されている陸上自衛隊施設隊が、首都ジュバで大規模な戦闘が起きた昨年７月７～１２日にまとめた日報を３カ月足らずで廃棄していた問題で、
これらの日報が存在していたことが６日、分かった。防衛省統合幕僚監部が同日、明らかにした。
日報は、ジャーナリストの布施祐仁さんが２０１６年９月３０日に情報公開請求したところ、防衛省が同１２月２日付で「既に廃棄」と回答していた。
神奈川新聞社の取材に対し、統合幕僚監部は「（廃棄を理由に不開示決定したが）その後再度、日報存否の範囲を広げて探索したところ、当初の探索範囲の外である統合幕僚監部（東京都新宿区）において日報が見つかった」と説明した。
情報公開請求があれば応じる、としている。
統合幕僚監部は当初、「報告を終えた時点で使用目的を達することになり、報告の終了をもって廃棄とした」と説明していた。
これを問題視した自民党行政改革推進本部長の河野太郎衆院議員（１５区）が防衛省に文書管理の改善と、日報を再度探すよう求めていた。
統合幕僚監部は河野議員に対し「電子データとして日報が残っていた」と説明。廃棄した、としていた日報全てが「残っている」と答えたという。
南スーダンでは１６年７月７～１２日かけて政府軍や反政府組織による大規模な戦闘があり２７０人以上が死亡、非政府組織（ＮＧＯ）の施設が襲われ女性職員がレイプされたり、略奪されたりした。
日報にはこのときの自衛隊の対応についても記載があるという。
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